全球冷藏集裝箱缺口和冷藏集裝箱運力不足是當前全球冷鏈面臨的大挑戰，即冷鏈貨物沒有足夠的集裝箱裝運，或者一大批冷凍集裝箱找不到適當的貨輪裝運，這是托運人感到頭痛的事情。隨著全球海產品、冷凍食品和新鮮蔬果進出口貿易量不斷增長，全球冷凍集裝箱設備和運力均出現不足，其缺口正逐漸擴大。
據英國倫敦近出版的“集裝箱化國際”報道，由于全球經濟衰退和國際金融危機沖擊，全球擁有冷藏箱載運功能的集裝箱船舶竣工和交付使用艘數明顯減少，2009年全年總共有312艘冷藏箱載運能力達到221066標箱的集裝箱船竣工和交付使用，與2008年相比，下降大約33%。而全球造船業2009年后一個季度竣工和交付使用的擁有冷藏箱載運功能的集裝箱船總共為60艘，其冷藏箱總運力達到36964標準箱，平均單船冷藏箱運力相當于其全船集裝箱運力的16.8%。
全球集裝箱船隊運力中的冷藏箱位數量過去幾年一直以年均10%比率增長，但是2009年僅僅增長1%，原因還是全球經濟衰退。
雖然2009年全球大部分貿易航線冷藏箱貨物運量比干貨箱要堅挺得多，但全球冷藏箱產量與前兩年相比卻急劇跌落60%，冷藏箱出廠價格也下滑。其原因是多方面的，如集裝箱設備原材料漲價、環境保護法律法規日益嚴格和集裝箱制造商出于產值和收益考慮等。截至2009年12月31日，40英尺大容積冷藏箱均價為每只16400美元，比2008年6月份均價低15%，所幸的是比2009年9月均價高出2.5%，即集裝箱出廠價格略有回升，令人感到一點鼓舞。有關專家預計今年冷藏箱價格將維持平穩，其增長率也不會超過10%。
據統計，截至2009年12月31日，全球新船訂單中的集裝箱船所擁有的冷箱運力達到603517標準箱，占新船400萬標箱總運力的15.3%。這些船將于2014年底前全部竣工和交付使用，屆時，全球集裝箱船隊冷藏箱運力將在目前約200萬標箱的基礎上增長30%。
國際冷藏集裝箱運輸市場的專家指出，根據發展態勢目前十分看好的全球冷藏集裝箱運輸市場其實處于產業不穩定狀態。
一方面是兩大冷藏運輸模式——冷藏集裝箱和傳統專用冷藏船之間的競爭。凡是熟悉集裝箱運輸的人士都十分清楚，冷藏箱可以一層一層疊放在擁有電源插頭的集裝箱船貨艙和甲板上，用同樣的方式也可以雙層疊放在火車上，公路運輸也非常方便，總之冷藏箱的水路和陸路長距離運輸相當方便。而在傳統或專用冷藏船上，盡管對其甲板進行改裝后也可以運輸一部分冷藏箱，但是數量有限，因為其貨艙大多適合散裝冷藏保鮮貨物，難以像集裝箱船那樣大批量高效率運載冷藏箱。冷藏箱運輸利潤高，如一只滿載草莓的40英尺冷藏箱從智利運到歐洲，只要船期不脫班和冷藏箱機械系統運營正常，可以平均盈利22034美元，如此好的經濟效益使世界各地冷藏貿易業界更加垂青冷藏箱運輸。為了迎合全球冷藏貿易迅猛發展的市場需求，冷藏箱運輸行業已加快投資開發步伐，近幾年冷藏箱貨運量增長率確實驚人，而冷藏船貨運量節節敗退，冷藏箱運輸模式頗有逐步取代傳統或專用冷藏船趨勢。
另一方面全球冷藏箱制造業產量卻一直在動蕩中發生總體跌落。
如果冷藏箱設備產量繼續停滯不前，甚至倒退，那么2010年以后的全球冷藏箱運力將難以滿足全球大部分貿易航線的冷藏集裝箱貨物運輸需求。一些專家預計到2012年，全球冷藏食品和其它產品總共有6500萬噸需要冷鏈服務支持，其中大約2000多萬噸需要冷藏船，4000多萬噸需要冷藏集裝箱從產地運輸到世界各地市場，按照2012年的全球冷鏈服務能力預算，仍然有大約500萬噸冷藏貨物供應鏈服務需求的缺口；以冷藏箱運輸為主體的全球冷鏈服務需求在可以預見的將來總是供不應求。
專家預測2015年全球冷藏保鮮貨物海運量將增加到1.15億噸，與2008年相比，增幅將達到40%。而到2015年冷藏箱和冷藏船所占全球冷藏貿易運輸份額將分別為70%和30%，也就是說冷藏箱將占據全球冷藏貿易運輸2/3。現在集裝箱船舶訂造增長率大幅度放慢，其冷藏箱運力擴展進程也受到一定的限制，冷藏箱供不應求現象一時難以避免。一旦冷藏箱設備供應量不足，冷藏箱運力缺口擴大，不僅會造成巨大經濟損失，而且還會影響到社會公眾日常生活，甚至造成社會動蕩。
2010年全球冷藏箱貨運量雖然并沒有出現飆升態勢，甚至冷藏箱日租金率居低不上，但是專家還是看出全球冷藏箱貨運市場有商機涌動。全球航運大戶看準并迎合全球冷凍貨運輸市場行情看漲的趨勢，不斷提升集裝箱船隊冷藏箱運力，目前丹麥馬士基、法國達飛，德國漢堡南方、新加坡美國總統輪船等國際集裝箱海運經營大戶不遺余力地投資開發其集裝箱船隊冷藏箱運力，因為這些航運大戶堅信，正在迅速攀高的全球冷凍貨海運量急需更多的擁有冷藏箱載運能力的集裝箱船，因此提高集裝箱船冷藏箱載運容積率是當務之急。隨著全球經濟回暖和大部分貿易航線集裝箱運量增長，冷藏箱運量必然迅速提高，而比普通集裝箱造價高得多的冷藏箱設備需求量和周轉量也必將水漲船高。
截至2009年底，全球冷藏箱設備擁有量達到170萬標箱，其中大部分是遠洋承運人自有箱，這是遠洋承運人連續多年擴大投資購置集裝箱設備，尤其是冷藏箱設備的結果。2008年全球遠洋承運人購置新集裝箱設備達到160000標準箱。而集裝箱出租人同年購置新集裝箱設備65000標準箱。2009年全球集裝箱出租公司購置25000標箱的集裝箱設備，相當于當年全球集裝箱設備總產量的30%，而2009年遠洋承運人購置大約45000標箱的集裝箱設備。丹麥馬士基、法國達飛，中國臺灣長榮、韓國韓進、以色列以星、德國漢堡南方等航運大戶一向積極投資購置自有集裝箱設備，尤其重視冷藏集裝箱設備，截至2008年底，全球遠洋承運人自有集裝箱設備擁有量達到124萬標準箱，2009年增長幅度不大，其自有集裝箱設備擁有量截至年底僅僅為125萬標準箱。
截至2007年12月31日，全球集裝箱出租公司的集裝箱設備擁有量占全球集裝箱設備運營總量的28.4%；截至2008年12月31日，全球集裝箱出租公司集裝箱設備擁有量為430000標準箱，占全球集裝箱設備運營總量的25.6%，由此看出全球集裝箱租賃公司的租賃箱在全球集裝箱擁有總量中的份額并不見擴大，2009年仍然維持這個份額。
目前許多航運大戶決定直接擴大投資，或者通過收購兼并地方冷鏈公司等手段，增加冷鏈集裝箱設備運力，不斷引進信息科學技術設施，不斷優化全球冷鏈集裝箱運輸質量、效率和效益，以從根本上鏟除當前仍然十分嚴峻的全球冷鏈集裝箱運輸經營管理結構缺陷。
